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科研快讯 | 新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的研究进展(三十九)

科研快讯 | 新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的研究进展(三十九)

1. COVID-19生物学研究进展 

■ 3月12日,国务院联防联控机制举办的新闻发布会上,国家卫生健康委新闻发言人、宣传司副司长米锋表示:武汉新增确诊病例8例,已经降至个位数;湖北除武汉以外,所有地市已连续1周无新增确诊病例;湖北以外省份,新增确诊病例7例,其中6例为境外输入病例。以上信息提示,总体上,我国本轮疫情流行高峰已经过去,新增发病数在持续下降,疫情总体保持在较低水平。要把医疗救治工作摆在第一位,不麻痹、不厌战、不松劲,毫不放松抓紧各项防控工作。

■ 3月12日,在广东省疫情防控例行新闻发布会上,钟南山院士表示,本次疫情在6月份结束是可以期待的。一般来说,冠状病毒在温度较高的夏天比较不活跃,不过,疫情的结束时间,也取决于各个国家的重视程度。假如一些国家不重视疫情的危害性和传染性,结束的时间就不好说了。此外,对于部分病人复检呈阳性的问题,钟南山表示,在香港的一项研究中,从复阳患者体内检测到的可能是新型冠状病毒的残余核酸片段,没有查出活病毒。因此基于目前的资料,尚未发现复阳病人有传染性。

2. COVID-19生物学研究进展

■ 3月11日,中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所谭文杰在国际顶级医学期刊JAMA在线发表题为“Detection of SARS-CoV-2 in Different Types of Clinical Specimens”的研究论文,该研究观察了新型冠状病毒在新冠肺炎(COVID-19)住院患者的不同组织之间的生物分布,这些患者是根据症状和放射学诊断并通过新型冠状病毒检测证实的,这项研究得到参与医院的伦理委员会的批准。该研究发现,从205名COVID-19患者的多个部位的标本中检测到新型冠状病毒,其中下呼吸道样品最常检测出该病毒。重要的是,在粪便中检测到活病毒,这表明新型冠状病毒可能通过粪便途径传播。一小部分血液样本的PCR检测结果呈阳性,这表明感染有时可能是全身性的。病毒通过呼吸道和呼吸道外途径的传播可能有助于解释疾病的迅速传播[1]。

■ 3月11日,预印本平台Preprints上发表一篇题为“Serological Test is an Efficient Supplement of RNA Detection for Confirmation of SARS-CoV-2 Infection”的论文,研究表明病毒RNA检测与血清学检测相结合,既能提高诊断的敏感性,又能保持较高的特异性。新型冠状病毒特异性血清检测对临床实践和公共卫生具有重要价值。研究人员采用了化学发光法、酶联免疫吸附试验(ELISA)、胶体金法检测血清总抗体(Ab)和免疫球蛋白(IgM)抗体。结果表明,三种方法对总Ab和IgM检测的敏感性和特异性均较高,与IgM相比,Ab检测的敏感性更高。研究结果表明,RNA和Ab试验的联合应用可以提高诊断的敏感性,同时保持较高的特异性,这被认为对临床实践和公共卫生具有重要价值。总体上,ELISA法和化学发光法检测Ab具有取样方便、高通量、高效、可定量或半定量的特点,胶体金法是一种实时、重点检测的方法。以上抗体检测方法应作为不同情况下RNA检测的有效补充,以提高诊断的敏感性和特异性[2]。

■ 3月8日,澳大利亚墨尔本大学等单位的研究者在预印本平台bioRxiv发表了题为“Direct RNA sequencing and early evolution of SARS-CoV-2”的论文。研究人员提供了新型冠状病毒的直接RNA序列,介绍了该冠状病毒亚基因组长度的mRNA结构,并描述了从共享数据中揭示的冠状病毒进化遗传学的信息。该研究使用了一种最近建立的基于高度平行纳米孔阵列的直接RNA测序方法,通过这种方法,新型冠状病毒样本在40小时的测序中产生了680347个读数,包含了860Mb的序列信息。与培养的新型冠状病毒分离株的基因组一致,部分读数属于冠状病毒序列(28.9%),包括分布在29893个碱基基因组中的367Mb序列。其中一些的长度超过2万个碱基,研究人员还捕获了单个分子上的大部分基因组。通过数据分析,他们确定了42个具有可预测的5-甲基胞嘧啶修饰的位点,这些位点在亚基因组长度的mRNA之间呈现一致的位置。在其他阳性单链病毒中,RNA甲基化在感染过程中会发生动态变化,影响宿主—病原体相互作用和病毒复制。一旦数据集可用于新型冠状病毒的直接RNA序列,研究人员可能会发现其他的修饰,而人们目前对冠状病毒的表观转录组修饰知之甚少。综上所述,研究人员认为,通过使用直接的RNA序列数据,有助于对新型冠状病毒分子生物学的深入了解,并可能帮助构建病毒亚基因组长度mRNA结构的详细视图[3]。

3. COVID-19药物学研究进展 

■ 由国家应急防控药物工程技术研究中心和深圳市第三人民医院刘磊、刘映霞团队合作完成的一项“法匹拉韦治疗新型冠状病毒肺炎(COVID-19)患者的安全性和有效性的临床研究”已得出初步临床结果(注册号:ChiCTR2000029600)。研究显示法匹拉韦(Favipiravir)可能通过加快病毒清除,达到缓解新型冠状病毒肺炎进展的疗效,目前研究结果已投稿至中国工程院院刊。本项临床试验共入组80例患者,法匹拉韦治疗组35例,对照组是年龄、性别和疾病严重程度与治疗组相匹配的45例新冠肺炎患者,接受洛匹那韦/利托那韦片治疗。比较两组的用药到病毒清除时间的中位数、疗程第14天胸部影像学改善率及安全性。研究结果显示,病毒清除方面,法匹拉韦试验组治疗后患者病毒清除(病毒核酸转阴)时间中位值显著短于对照组,分别为4天和11天。而在另一关键指标,患者胸部影像学改善方面,治疗组与对照组相比,改善率分别为91.43%和62.22%。同时,与对照组相比,法匹拉韦治疗组的不良反应少,耐受性更好。两组患者的所有基线特征均具有可比性。

4. COVID-19流行病学研究 

■ 2020年3月12日,武汉大学蓝柯、刘映乐,华中科技大学孙自镛及复旦大学余宏杰共同通讯在国际顶级医学期刊NEJM在线发表题为“Detection of Covid-19 in Children in Early January 2020 in Wuhan, China”的研究论文,该研究对2020年1月7日至1月15日,共366名住院儿童(≤16岁)进行了回顾性研究。在366名儿童中,最常见的病原体是甲型流感病毒(占23例[6.3%])和乙型流感病毒(占20例[5.5%])。在6例患者中(1.6%)检测到了导致Covid-19的病毒新型冠状病毒。该研究从Covid-19患者的父母或监护人那里获得了知情同意,以公布其临床数据。6名Covid-19患者的发病日期在2020年1月2日至1月8日之间,并且患者在1月7日至1月13日之间住院。这项研究结果显示,在新型冠状病毒暴发的早期,Covid-19发生在这些患者儿童中,会引起中度至重度呼吸系统疾病,且与一名患者的ICU入院有关,而患者儿童或家属均没有直接接触过华南海鲜批发市场或彼此直接接触过[4]。

■ 2020年3月12日,新加坡国家传染病中心Oon-Tek Ng等人在国际顶级医学期刊NEJM在线发表题为“SARS-CoV-2 Infection among Travelers Returning from Wuhan, China”的研究论文,该研究追踪了2020年1月30日登上从武汉到新加坡航班的94人。

在登机时和登机前进行的体温检查,阻止了3例高热人士登机。抵达新加坡后,对乘客进行了一次体温检查(发烧定义为体温≥38°C),发现2人(一名48岁的女性[患者1]和一名47岁的女性[患者2])发烧了。2名发热妇女立即被送往医院,她们的新型冠状病毒的检测结果呈阳性。其余的92名发热旅客(年龄在2至82岁之间)在政府检疫机构隔离了14天,在那里他们每天进行三次症状和发烧检查。有六名患者报告了症状,所有6个人的新型冠状病毒测试均为阴性。在检疫第3天,从86名无症状者中的76名(75支鼻咽拭子样本和1支鼻拭子样本)中获取了样本,并通过PCR分析进行了测试。一个17岁的男孩(患者1的儿子)检测到Covid-19呈阳性,并在2周内继续呈PCR阳性状态,而一个41岁的男人没有定论(N基因和ORF1ab基因阴性)。在检疫第6天,从所有87名被隔离的无症状人员中抽取了样本(85例鼻咽拭子样本和2例鼻拭子样本,经过测试均为阴性)。第14天,所有未在医院隔离的人都被隔离检疫,所有患者均未感染Covid-19。从无症状或症状轻微的Covid-19病例中了解新型冠状病毒感染的传播意义对于制定围堵策略至关重要[5]。

 

参考文献:

[1] W. Wang, Y. Xu, R. Gao, et al. Detection of SARS-CoV-2 in Different Types

of Clinical Specimens. JAMA 2020.

[2] Xia, N.; Wang, G.; Gong, W. Serological Test is an Efficient Supplement of RNA Detection for Confirmation of SARS-CoV-2 Infection. Preprints 2020, 2020030184.

[3] Taiaroa G, Rawlinson D, Featherstone L, et al. Direct RNA sequencing and early evolution of SARS-CoV-2. bioRxiv 2020:2020.03.05.976167.

[4] Liu W, Zhang Q, Chen J, et al. Detection of Covid-19 in Children in Early January 2020 in Wuhan, China. New England Journal of Medicine 2020.

[5] Ng O-T, Marimuthu K, Chia P-Y, et al. SARS-CoV-2 Infection among Travelers Returning from Wuhan, China. New England Journal of Medicine 2020.

 

供稿 | 坪山生物医药研发转化中心、科研部

来源 | 人民日报、转化医学网、iNature、科学网、环球科学

编辑 | 鲍啦

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